子科生物（https://show.guidechem.com/zikerbio/）报道：SARS-CoV-2病毒还继续在全球范围内肆虐。研究人员和科学家一直在寻找治疗COVID-19的多种方法，包括重新利用已批准的药物。这项研究指出了非常有前途的治疗方法。

芝加哥大学Pritzker分子工程学院（PME）的一组研究人员利用最先进的计算机模拟技术，找到了一种可以快速解决COVID-19大流行的药物。

他们的发现发表在8月14日的《COVID-19》，题为“Molecular Characterization of Ebselen Binding Activity to SARS CoV 2 Main 4 Protease”。

Mpro与Ebselen

2月初，Juan de Pablo教授和他的学生们对大流行的迅速发展感到担忧，于是他们利用分子建模专业知识，寻找针对这种疾病的治疗方法。与此同时，世界各地的其他组织也开始使用超级计算机快速筛选数千种现有化合物，以备用于抗击SARS-CoV-2病毒。

de Pablo解释说：“由于高通量筛选所考虑的化合物数量庞大，计算必须做一定数量的精简，然后再使用实验和更精确的计算来评估实际效果。”

研究人员首先专注于寻找病毒的弱点。他们选择了它的主要蛋白酶：Mpro。Mpro是一种重要的冠状病毒酶，在病毒的生命周期中起着重要作用，有助于病毒转录RNA和在宿主细胞内复制基因组的能力。

一种显示有希望成为对付Mpro武器的药物是Ebselen。Ebselen是一种具有抗病毒、抗炎、抗氧化、杀菌和细胞保护特性的化合物。Ebselen用于治疗多种疾病，包括双相情感障碍和听力损失。例如，Ebselen与silver联合治疗5种临床上难以控制的耐药革兰氏阴性菌等几项临床试验已经证明了它对人体的安全性。

工作原理

de Pablo和他的学生着手开发酶和药物的详细模型。利用这些模型和复杂的超级计算机模拟，他们发现小的Ebselen分子能够以两种不同的方式降低Mpro的活性。

de Pablo说：“除了在酶的催化位点上结合外，Ebselen还与一个遥远的位点有很强的结合，这一点依赖于一种机制，即信息通过细微的结构重组从大分子的一个区域传递到另一个远离它的区域，从而干扰酶的催化功能。”

这一发现特别重要，因为它有助于解释Ebselen作为一种重新利用药物的潜在疗效，并且揭示了病毒中一个以前不为人所知的新弱点，可以用来开发针对COVID-19的新治疗策略。

通过昼夜努力，团队在两个月内完成了他们的工作，并于四月将他们的手稿提交给公共研究档案，供其他人考虑。

药物开发潜力

研究小组发现了两个结合位点，因此Ebselen有望成为设计和开发新型Mpro抑制剂和COVID-19治疗的新药。

“主要蛋白酶是病毒中许多蛋白质中的一种，这些蛋白质可以被现有的、重新利用的药物作为靶点，有成千上万种化合物需要考虑，”de Pablo说。“我们正在系统地调查与病毒功能有关的每一种蛋白质，并调查它们的脆弱性及其对各种药物的反应。”

de Pablo和他的团队很快将发布一份关于该病毒的RBD/ACE2复合物的综合研究报告，以及另一种有望干扰病毒与细胞结合的药物。

原文检索：Molecular Characterization of Ebselen Binding Activity to SARS CoV 2 Main 4 Protease