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深圳大学最新发文:番茄缺磷过程DNA甲基化变化模式

2022-04-21

子科生物报道:番茄Solanum lycopersicum L.)果实具有丰富的营养价值,作为重要的经济作物,是世界范围内生产及消耗最大的蔬菜之一。番茄果实的成熟过程会出现乙烯合成、色素的积累、风味物质形成以及果实的软化等变化,该过程受到植物激素、转录因子、表观遗传修饰等因素共同调控。microRNA作为一种重要转录后调控因子,在植物多种生长及生理过程中起重要作用,然而其对果实成熟和品质的形成的调控机制仍有待进一步阐明。

近日,深圳大学生命与海洋科学学院黄腾波教授课题组在植物学权威杂志Plant Biotechnology Journal(中科院一区TOP期刊,影响因子9.803)在线发表了题为“SlMIR164A regulates fruit ripening and quality by controlling SlNAM2 and SlNAM3 in tomato”的研究论文。该研究通过对番茄microRNA164前体基因SlMIR164A在果实叶绿体发育和果实成熟过程中的功能解析,揭示了microRNA通过特定靶基因介导,从而精细调控果实成熟和品质的机制。


该研究从番茄中鉴定到受乙烯诱导且在果实成熟过程中上调表达的 Sly-miR164前体家族成员SlMIR164A,并通过CRISPR/Cas9基因编辑技术创建SlMIR164A突变体slmir164aCR。对slmir164aCR进行表型分析发现,SlMIR164A 可影响果实叶绿体发育、抑制果实成熟,并调节果实风味物质形成(图1和图2)。接下来还利用转录组、EMSA、双荧光素酶转录激活等实验发现SlMIR164A的靶基因SlNAM2/SlNAM3 能够激活叶绿体发育、光合作用、乙烯合成、类胡萝卜素合成和细胞壁降解等相关基因的转录。


图 1. SlMIR164A调节果实叶绿体和有色体的发育

图 2. SlMIR164A调节果实成熟且受乙烯诱导

图3. slmir164aCR 果实中抑制SlNAM2/SlNAM3 影响果实成熟和品质形成

该研究还揭示,在slmir164aCR 中利用VIGS抑制SlNAM2/SlNAM3 可推迟果实成熟,并抑制果实中糖、酸等代谢产物积累,进一步验证SlNAM2/SlNAM3在介导SlMIR164A精细调控果实成熟和风味物质形成中的关键作用(图3)。上述研究结果不仅为阐明microRNA在转录后水平上调控果实成熟和品质形成的机理提供理论依据,同时也为利用基因工程技术进行果实类作物品种改良提供新的思路。