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继张锋团队之后,Jennifer Doudna团队也报告了一项CRISPR检测技术

2020-12-08

子科生物(https://show.guidechem.com/zikerbio/)报道:加州大学伯克利分校Gladstone研究所和加州大学旧金山分校的科学家在Daniel Fletcher和Jennifer Doudna等人领导下开发了一款连接智能手机的COVID-19病毒检测技术,从擦拭鼻孔到手机报告结果,仅需15-30分钟,比张锋早些时候报道的“CARVER”用时短了不少。

这篇文章于12月4日发表在《Cell》杂志上。之前的CRISPR诊断要求病毒RNA在被检测之前转化为DNA并进行扩增,而这篇文章描述的方法跳过了所有的转化和扩增步骤,使用CRISPR直接检测病毒RNA。新诊断测试不仅可以产生阳性或阴性结果,还可以测量给定样本中的病毒载量(SARS-CoV-2的病毒浓度)。

在新的测试中,Cas13蛋白与一个报告分子结合,这个分子在切割时发荧光,然后与来自鼻拭子的患者样本混合。样本被放置在一个连接到智能手机的设备中。如果样本中含有来自SARS-CoV-2的RNA,Cas13将被激活并切断报告分子,从而产生荧光信号。然后,智能手机的摄像头,本质上转换成了显微镜,可以检测到荧光并报告结果。

“这种检测方法的独特之处在于它使用一步反应直接检测病毒RNA,而不是传统PCR检测中的两步反应,”这项研究的领导者之一、Gladstone病毒学研究所所长Melanie Ott说。“更简单的化学检测不需要复杂的检测设备,它还允许测试产生定量的测量结果,而不是简单的正或负结果。”

研究人员还说,他们的检测方法可以适用于各种手机,使这项技术更容易获得。

当科学家们用病人样本测试他们的设备时,他们证实了它可以为具有临床相关病毒载量的样本提供一个非常快的结果周转时间。事实上,该设备在不到5分钟内就准确地检测到一组阳性样本。对于病毒载量低的样本,该设备需要30分钟才能将其与阴性测试区分开。

新的基于CRISPR的测试不仅为快速测试提供了一个很有前途的选择,而且通过使用智能手机和避免对笨重的实验室设备的需要,它有可能变得便携,并最终提供给医疗点甚至家庭使用。而且,它还可以扩展到诊断SARS-CoV-2以外的其他呼吸道病毒。

此外,智能手机摄像头的高灵敏度,加上它们的连接性、GPS和数据处理能力,使它们成为低资源地区诊断疾病的有吸引力的工具。

“我们希望将我们的测试开发成一种设备,能够在维护患者隐私的同时,立即将结果上传到基于云的系统中,这对于联系追踪和流行病学研究非常重要,”Ott说。“这种基于智能手机的诊断测试可以在控制当前和未来的流行病方面发挥关键作用。”

原文检索:Amplification-free detection of SARS-CoV-2 with CRISPR-Cas13a and mobile phone microscopy